مطالعه تنوع ژنتیک باکتری‌های سینوریزوبیوم با استفاده از تکنیک PCR / RFLP 16S-23S rDNA

نویسندگان

  • اصغرزاده, احمد
  • حق نیا, غلامحسین
  • خاوازی, کاظم
  • کریمی, اسماعیل
  • لکزیان, امیر
چکیده مقاله:

  It is important to investigate the genetic diversity and evaluate symbiotic effectiveness of the indigenous rhizobial population. It helps understand the responses of indigenous isolates to different rhizobial inoculants. In spite of the importance of bacterial diversity, there are a few scientific reports about it in Iranian soils. Genetic diversity of 150 isolates of Sinorhizobium isolated from Hamadan soils was studied by using PCR / RFLP 16S-23S rDNA technique. The results showed that all isolates clustered in three different groups. Group (I) formed 122 isolates and they were quite similar to Sinorhizobium meliloti from viewpoint of genetic characteristics. Twenty five isolates were clustered in Group (II) and they belonged to Sinorhizobium medicae. Group (III) had two isolates and they were new species and quite different from the other groups. Shannon diversity index was different within eleven different land units (Medium gradient mountains, Level lands, Plateau, Foot slopes, Depressions and Composite land) and there was a correlation between Shannon index and some soil properties. Difference in Similarity index showed that Sinorhizobium groups in each land unit were different.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مطالعه تنوع ژنتیک باکتری های سینوریزوبیوم با استفاده از تکنیک pcr / rflp ۱۶s-۲۳s rdna

مطالعه تنوع ژنتیک باکتری های ریزوبیومی و ارزیابی کارآیی همزیستی آنها در جمعیت های بومی خاک به منظور شناخت پاسخ آنها به سویه های تلقیح شده به خاک و هم چنین نقش مدیریت های متفاوت بر تنوع این باکتری ها از اهمیت ویژه ای برخوردار است. مطالعات بسیار اندکی پیرامون تنوع ژنتیکی باکتری های ریزوبیومی بومی ایران انجام شده و گزارشی راجع به باکتری های بومی ریزوبیومی از لحاظ ژنتیکی ارائه نشده است. به همین منظ...

متن کامل

Identification of acetic acid bacteria by RFLP of PCR-amplified 16S rDNA and 16S-23S rDNA intergenic spacer.

DNA corresponding to 16S rDNA and the 165-23S rDNA intergenic spacer (ITS) from 22 reference strains of acetic acid bacteria, representing the diversity of the family Acetobacteraceae, and 24 indigenous acetic acid bacteria isolated from wine fermentations were analysed by PCR-RFLP. Frateuria aurantia LMG 1558T and Escherichia coli ATCC 11775T were included as outgroups. PCR-amplified products ...

متن کامل

16S rDNA genotyping using PCR/RFLP (restriction fragment length polymorphism) analysis among the family Vibrionaceae.

The 16S rDNA genotypes among the family Vibrionaceae were determined using PCR/RFLP analysis. Five tetrameric restriction enzymes (HhaI, DdeI, RsaI, Sau3AI and MspI) were used for RFLP analysis and adequate numbers of informative bands were obtained from each enzyme. Twenty-seven genotypes were obtained from 49 type and reference strains including 35 species. Nineteen species could be assigned ...

متن کامل

Genomic-Based Restriction Enzyme Selection for Specific Detection of Piscirickettsia salmonis by 16S rDNA PCR-RFLP

The gram negative facultative bacterium P. salmonis is the etiological agent of Salmonid Rickettsial Septicaemia (SRS), a severe disease that causes important economic losses in the global salmon farmer industry. Despite efforts to control this disease, the high frequency of new epizootic events indicate that the vaccine and antibiotics treatments have limited effectiveness, therefore the preve...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 11  شماره 42

صفحات  441- 449

تاریخ انتشار 2008-01

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023